5月22日，上海轨道交通3号线、6号线、10号线、16号线首先恢复运营，运营时段均为早上7时到晚上8时，行车间隔约为20分钟。

在本轮上海疫情中，自4月2日至5月10日，上海地铁20条线路中仅6号线和16号线仍为乘客提供运营服务。自5月10日13时起，6号线和16号线也全线停运，直至22日复运。

5月22日早上不到7点，中青报·中青网记者在上海地铁3号线虹口足球场站看到，地铁站尚未开门时，一名乘客就已到达地铁站入口处等待。她告诉记者，她准备乘坐地铁前往虹桥火车站，接着搭乘高铁前往南京，再转站回安徽老家。原本她打算骑自行车前往高铁站，后听闻地铁将于5月22日复运，便购买了地铁复运当天的离沪车票。记者在地铁3号线、10号线注意到，车厢内的乘客大多数都带着行李箱，准备前往虹桥火车站乘火车离开上海。

乘客进入地铁站前，需要扫“场所码”。根据上海市有关防疫要求，市民乘坐地铁应出示“随申码”绿码和48小时内核酸检测阴性证明，体温也需正常（＜37.3℃）。为方便乘客扫码，“场所码”张贴在站外出入口、站内通道、安检点、服务中心、自动售票机等醒目位置。老年人、视障人群等确因特殊情况无法扫“场所码”的，可持保通卡或经身份关联的交通卡，或者48小时内核酸检测阴性证明（可纸质）乘车。

在5月21日举行的上海市新冠肺炎疫情防控工作第190场新闻发布会上，申通地铁集团副总裁邵伟中介绍说，上海地铁已经制定了疫情应急处置预案。如发生多人次涉疫情况或周边地区疫情严重（被列为中高风险地区等），将实施封站跳停、缩线运营等措施。车站内设置了临时隔离区，配置被隔离人员穿戴的防护服、N95/KN95口罩等用品，满足人员单独隔离所需。如果发生乘客涉疫事件，地铁将配合属地防控部门做好信息登记、闭环转运、环境消杀等应急处置工作。