台陆委会6月1日发布消息称，旺旺中时媒体集团为求在大陆发展利益，协助大陆办理具有统战意涵的海峡两岸中华文化峰会，并唱和大陆损害台湾“主权”，严重危害台湾利益。台陆委会声称，将检视该媒体集团行为是否涉及和大陆党政军合作而违反“两岸人民关系条例”，依法处理。

对此，旺旺中时媒体集团旗下《中国时报》发表声明回应称，根据“两岸人民关系条例”等，台湾、大陆同属一个中国，台湾人就是中国人，本是中华儿女，这是我们一贯立场，呼吁大家一起为两岸和平及台湾未来打拼。

对此台湾地区前民意代表蔡正元表示赞同，并提到自己的祖先400年前就从大陆来到台湾开垦，“我祖先是中国人，我们为什么不是？这还要解释吗?”